要想成為流式細(xì)胞術(shù)大神
既要了解流式細(xì)胞術(shù)的原理
又要懂得熒光素的選擇
最重要的是
讀 懂 流 式 圖!
流式圖有單參數(shù)直方圖、二維散點(diǎn)圖、二維等高線圖與密度圖,三維圖以及假三維圖,其中最常用的是二維散點(diǎn)圖和單參數(shù)直方圖。本文主要對(duì)二維散點(diǎn)圖、單參數(shù)直方圖及一些常見問題進(jìn)行介紹。
1.二維散點(diǎn)圖
二維散點(diǎn)圖能夠表示兩個(gè)獨(dú)立參數(shù)與細(xì)胞相對(duì)數(shù)之間的關(guān)系,橫坐標(biāo)和縱坐標(biāo)分別代表與細(xì)胞有關(guān)的兩個(gè)獨(dú)立參數(shù),平面上每一個(gè)點(diǎn)表示具有相應(yīng)坐標(biāo)值的細(xì)胞。散點(diǎn)圖是一種雙變量描述,可被分為四象限,至少產(chǎn)生四種可能的結(jié)果來明確區(qū)分陰性和陽性。其結(jié)果用整個(gè)散點(diǎn)圖中出現(xiàn)的特定象限的細(xì)胞占全部細(xì)胞的百分率表示,每個(gè)點(diǎn)表示一個(gè)單獨(dú)事件。這四個(gè)象限分別用LL,UL,UR,LR表示。
圖1:CD4/FITC(BF00201)、CD8/APC-Cy7(BF00321)雙染
看圖技巧:
LL(左下):表示對(duì)于X軸所代表的參數(shù)呈陰性,對(duì)于Y軸所代表的參數(shù)呈陰性反應(yīng)的細(xì)胞,如圖表示CD8、CD4雙陰性細(xì)胞。
UL(左上):表示對(duì)于Y軸所代表的的參數(shù)呈陽性,對(duì)于X軸所代表的參數(shù)呈陰性反應(yīng)的細(xì)胞,如圖表示CD8+、CD4-細(xì)胞。
UR(右上):表示對(duì)于X軸、Y軸所代表的參數(shù)呈雙陽性的細(xì)胞,如圖表示CD8+、CD4+雙陽性細(xì)胞。
LR(右下):表示對(duì)于X軸所代表的參數(shù)呈陽性反應(yīng),而對(duì)Y軸所代表的參數(shù)呈陰性反應(yīng)的細(xì)胞,如圖表示CD8-、CD4+細(xì)胞。
大神支招:必須先了解X軸、Y軸各自所代表參數(shù)的意義;再看四個(gè)象限,并了解各象限意義;數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)時(shí),檢測(cè)目的物一般用各象限區(qū)內(nèi)的細(xì)胞數(shù)占門內(nèi)細(xì)胞數(shù)百分比或平均熒光強(qiáng)度表示 。
單參數(shù)直方圖是一維數(shù)據(jù)用的最多的圖形顯示形式,即可用于定性分析,又可用于定量分析。每一個(gè)細(xì)胞單參數(shù)的測(cè)量數(shù)據(jù)可以整理成統(tǒng)計(jì)分布,以直方圖的方式來顯示。在圖中,橫坐標(biāo)表示熒光信號(hào)或散射光信號(hào)相對(duì)強(qiáng)度的值,其單位是道數(shù)(channel),可以是線形(line)或者對(duì)數(shù)(log)??v坐標(biāo)一般是相對(duì)細(xì)胞/粒子數(shù)(count)。利用直方圖來設(shè)門分析,可得到細(xì)胞數(shù)目(events)、門內(nèi)細(xì)胞百分比(%gated)、平均熒光強(qiáng)度(mean)、中位數(shù)(median)等統(tǒng)計(jì)參量,總的來說單參數(shù)直方圖只能表示具有同一特征細(xì)胞的數(shù)量及其熒光強(qiáng)度。
圖2:左為細(xì)胞周期(BA00205)分析;右為CD4/FITC(BF00201)表達(dá)情況
看圖技巧:先看橫縱坐標(biāo)了解檢測(cè)目的,縱坐標(biāo)代表細(xì)胞數(shù)(如圖細(xì)胞周期分析(BA00205);G1表示細(xì)胞進(jìn)行大量遺傳物質(zhì)合成的時(shí)期,G2表示DNA復(fù)制結(jié)束和開始有絲分裂之間的間隙,圖右為CD4/FITC(BF00201)的蛋白表達(dá)情況);看圖形分布,直方圖峰型越往右移,代表其熒光強(qiáng)度越強(qiáng)。(右圖中M2區(qū)域細(xì)胞的熒光強(qiáng)度要高于M1區(qū)域細(xì)胞的熒光強(qiáng)度);M1的確定是根據(jù)陰性對(duì)照細(xì)胞的基礎(chǔ)熒光閾值設(shè)定的,峰型右移熒光信號(hào)大于基礎(chǔ)熒光閾值M1,表示陽性M2。
Q&A
Q1:流式圖中的顏色與熒光顏色是否一致?
A:與熒光顏色無關(guān),流式圖中的顏色為人為指定。
Q2:流式圖中的陰/陽(N/P)如何劃分?
A:實(shí)際上這個(gè)M1的劃分完全是根據(jù)陰性(同型)對(duì)照來的,即使用同型抗體進(jìn)行平行實(shí)驗(yàn),反映待測(cè)標(biāo)本對(duì)抗體非特異性結(jié)合的水平,以幫助省去繁瑣的競(jìng)爭(zhēng)封閉步驟。右圖即陽性組,也就是接受刺激后的蛋白表達(dá)情況。
Q3: 這么巧,陰性正好在101劃分?
A:其實(shí)我們可以人為地將電壓、放大倍數(shù)調(diào)到相應(yīng)的大小,使陰性的右邊界在某一個(gè)值上,(通常劃在101附近)這樣后期做sample時(shí)好看,當(dāng)然也可以調(diào)到102,103次方。
Q4:為什么要進(jìn)行熒光補(bǔ)償?
A:流式細(xì)胞分析中經(jīng)常要用到2種以上的熒光標(biāo)記抗體進(jìn)行染色,而目前所使用的多種熒光染料發(fā)射譜間有一定重疊?!盁晒庋a(bǔ)償”這個(gè)術(shù)語是指修正熒光滲漏的過程,如從探測(cè)器除去匹配熒光以外的任何熒光信號(hào)。
Bioss 流式細(xì)胞技術(shù)服務(wù)
可檢測(cè)項(xiàng)目:
1、細(xì)胞周期檢測(cè):包括細(xì)胞培養(yǎng),細(xì)胞周期同步化,細(xì)胞進(jìn)行加藥處理,細(xì)胞收集乙醇固定,PI染色上機(jī)樣本制備,流式上機(jī)檢測(cè),數(shù)據(jù)分析。
2、細(xì)胞凋亡檢測(cè):包括細(xì)胞培養(yǎng),細(xì)胞進(jìn)行加藥誘導(dǎo)處理,細(xì)胞收集樣本制備,流式上機(jī)檢測(cè),數(shù)據(jù)分析。
3、免疫細(xì)胞分型:包括細(xì)胞收集樣本制備,流式上機(jī)檢測(cè),數(shù)據(jù)分析。
4、細(xì)胞表面抗原鑒定:包括細(xì)胞收集樣本制備,流式上機(jī)檢測(cè),數(shù)據(jù)分析。
5、同城上機(jī)檢測(cè):由客戶制備好樣本,流式上機(jī)檢測(cè),數(shù)據(jù)分析。
服務(wù)編號(hào) |
服務(wù)項(xiàng)目 |
實(shí)驗(yàn)周期 |
SV1401 |
細(xì)胞周期檢測(cè) |
3-5天 |
SV1402 |
細(xì)胞凋亡檢測(cè) |
3-5天 |
SV1403 |
免疫細(xì)胞分型 |
2-3天 |
SV1404 |
表面抗原鑒定 |
2-3天 |
SV1405 |
同城上機(jī)檢測(cè) |
1-2天 |
Bioss 檢測(cè)案例
八色小鼠脾臟免疫表型分析
1)在FSC/SSC圖上,設(shè)門P1圈出淋巴細(xì)胞;基于淋巴細(xì)胞在FSC-H/FSC-A圖上設(shè)門E2圈出單個(gè)細(xì)胞排除粘連體;基于E2在7-AAD/SSC圖上設(shè)門R3圈出7-AAD陰性的活細(xì)胞。
2)基于R3門,在CD3/CD19圖上設(shè)十字門,CD3+CD19-為T細(xì)胞,CD3-CD19+為B細(xì)胞。
3)基于R3門,在CD3/NK1.1圖上設(shè)十字門,CD3-NK1.1+為NK細(xì)胞,CD3+NK1.1+為NKT細(xì)胞。
4)基于CD3+T細(xì)胞,在CD4/CD8a上設(shè)十字門,CD4+CD8-為輔助性T細(xì)胞,CD4-CD8+為細(xì)胞毒性T細(xì)胞。
5)基于CD3+T細(xì)胞,在CD8a/CD103和CD25/CD4圖上分析CD103、CD25的表達(dá)情況。
圖3:八色小鼠脾臟免疫表型分析
經(jīng)典雙激光六色熒光搭配方案
激發(fā)光 |
檢測(cè)通道 |
檢測(cè)指標(biāo) |
Bioss產(chǎn)品 |
藍(lán)光 |
530/30 |
CD3/FITC |
BF00101 |
575/30 |
CD4/PE |
BF00202 |
|
710/50 |
CD8/PerCP |
BF00303 |
|
780/60 |
CD19/PE-Cy7 |
BF00519 |
|
紅光 |
660/20 |
CD34/APC |
BF00604 |
780/60 |
CD45/APC-Cy7 |
BF00421 |