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開學(xué)季技術(shù)大講堂——(二)抗體的選擇
發(fā)表者:北京博奧森生物      發(fā)表時間:2019-9-23

隨著生命科學(xué)的發(fā)展,圍繞蛋白進(jìn)行的研究越來越多,抗體試劑在實(shí)驗(yàn)中的重要性越來越舉足輕重。面臨著紛呈復(fù)雜的抗體試劑市場,如何選擇到適合自己實(shí)驗(yàn)的抗體就變得尤為重要。

一、一抗選擇需要確定或參考的信息

(一)目的蛋白的信息

確定想檢測的目的蛋白是否與抗體識別蛋白信息吻合,注意中英文名字、別名等信息。

某些蛋白具有多種不同的亞型,這需要在選擇抗體之前確定要研究的蛋白亞型。還有些抗體由于其抗原選擇的是不同蛋白亞型共有的肽段區(qū)域,是可以同時識別多個亞型的。有的蛋白通過剪切加工才能轉(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓幕钚孕问?,如Caspase、Insulin等,這就需要根據(jù)研究需要,選擇針對前體或成熟形式的特異性抗體。

(二)抗體制備所用抗原的信息

抗體是由各種不同抗原免疫宿主而制備得來,抗原類型包括:全長蛋白、蛋白片段、多肽、全有機(jī)體(如:細(xì)菌)或細(xì)胞,抗體說明書一般都有制備抗體所用抗原的描述。在有些情況下,需要查閱抗體制備相關(guān)抗原信息來選擇抗體。比如,針對重組表達(dá)蛋白選擇抗體,如果是表達(dá)部分蛋白片段,則需要注意抗體的抗原區(qū)域是否在該片段區(qū)域內(nèi)。某些特殊蛋白(如病原體蛋白)未經(jīng)過內(nèi)部驗(yàn)證種屬的目的蛋白,需要求助生產(chǎn)商進(jìn)行蛋白同源性序列比對,并結(jié)合制備抗體所用的抗原序列,查看交叉反應(yīng)的情況。

(三)修飾位點(diǎn)的信息

在選擇合適的抗體用于特定修飾位點(diǎn)研究時,需要特別注意,不同位點(diǎn)的修飾可能有不同的機(jī)制存在,不宜一概而論。有關(guān)不同修飾位點(diǎn)的功能,可以通過查閱文獻(xiàn)確定。另外,由于有的蛋白存在不同亞型且序列高度同源,而不同亞型的某些磷酸化修飾位點(diǎn)周圍的序列完全相同,因此針對這些保守的修飾位點(diǎn)的抗體往往會同時識別不同亞型的相似修飾位點(diǎn)。

(四)實(shí)驗(yàn)樣本的種屬信息

抗體一般會在出廠前對常見的不同種屬目標(biāo)樣本進(jìn)行內(nèi)部驗(yàn)證,以確定可以滿足的不同種屬類型,可以在產(chǎn)品說明書的Species-Reactivity一欄中看到(如人、小鼠、大鼠等)。通過驗(yàn)證,達(dá)到質(zhì)檢要求的種屬會明確標(biāo)記,以備參考。沒有做過關(guān)于這些種屬的實(shí)驗(yàn),所以不建議使用。一些沒有標(biāo)明的種屬,也有可能是可以應(yīng)用的,建議通過聯(lián)系抗體公司技術(shù)支持來獲得相關(guān)抗原序列比對的信息,根據(jù)蛋白同源性的情況以確定是否可以用于該種屬的樣本。為了避免實(shí)驗(yàn)風(fēng)險,盡量不要使用說明書中沒有提及的標(biāo)本的種屬的抗體。

(五)抗體應(yīng)用的實(shí)驗(yàn)類型

抗體一般會在出廠前對常見的抗體應(yīng)用(WB、IP、ChIP、IHC、IF、FCM)進(jìn)行內(nèi)部驗(yàn)證,以確定是否可以滿足不同應(yīng)用要求。通過驗(yàn)證,達(dá)到質(zhì)檢要求的抗體會明確標(biāo)記,以備參考。一些沒有標(biāo)明的應(yīng)用,往往是因?yàn)榻?jīng)過驗(yàn)證沒有達(dá)到質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn)而不推薦,千萬不要根據(jù)經(jīng)驗(yàn)或常識去推測某個抗體的應(yīng)用。比如,有的客戶會認(rèn)為,既然某個抗體可以用于IHC,根據(jù)經(jīng)驗(yàn)推斷應(yīng)該可以用于IF,但畢竟這是不同的兩個應(yīng)用,這樣做可能會浪費(fèi)很多時間和試劑而不能獲得結(jié)果。抗體廠家不推薦您使用沒有標(biāo)明的應(yīng)用,可以挑選其他的貨號,可能有適用于這個應(yīng)用的更好的其它產(chǎn)品。如果抗體說明書沒有提及的應(yīng)用類型,并不意味著該抗體不適用于此種應(yīng)用類型,而僅是說明尚未經(jīng)過此種應(yīng)用的內(nèi)部驗(yàn)證。為了避免實(shí)驗(yàn)風(fēng)險,當(dāng)說明書中沒有提及的應(yīng)用方法時,可向生產(chǎn)商申請?jiān)囉醚b,進(jìn)行初步預(yù)實(shí)驗(yàn)后,再決定是否購買。

(六)標(biāo)記物的信息

有一些實(shí)驗(yàn),如多重免疫熒光、多指標(biāo)流式測定可能會使用到直接標(biāo)記的一抗(簡稱直標(biāo)一抗)。在進(jìn)行直標(biāo)一抗選擇時,需要了解到自己將要使用的儀器能檢測到的熒光范圍,針對不同的參數(shù)要求選擇合適的標(biāo)記物。在設(shè)計(jì)多重實(shí)驗(yàn)時,應(yīng)考慮每種熒光基團(tuán)的獨(dú)特性質(zhì),如最大吸收波長和最大發(fā)射波長,消光系數(shù)和斯托克斯位移等因素。有關(guān)標(biāo)記物選擇的細(xì)節(jié),我們將在后面的免疫熒光與流式技術(shù)部分詳加介紹。

(七)文獻(xiàn)引用情況

有的時候,針對某一個蛋白可能有不同貨號的產(chǎn)品,很多人喜歡通過查閱文獻(xiàn)來確定自己將要選擇的抗體貨號是否有過較好的表現(xiàn)。一般抗體公司都會收集引用自己產(chǎn)品的文獻(xiàn),這些產(chǎn)品都是經(jīng)過SCI驗(yàn)證過的,所以大可放心的使用。不過,也不排除抗體公司近期生產(chǎn)出更好的抗體,可以向公司咨詢。


二、二抗選擇需要確定或參考的信

(一)一抗的來源種屬

主要根據(jù)一抗來源種屬而決定二抗來源,如一抗是小鼠來源,那二抗就買抗小鼠的即可。

(二)二抗應(yīng)用的實(shí)驗(yàn)類型

針對不同的實(shí)驗(yàn)應(yīng)用,需要考慮二抗所偶聯(lián)的標(biāo)記物,如HRP、Biotin、熒光素等標(biāo)記物。WB與IHC所用的二抗,所帶的標(biāo)記物主要選擇HRP和Biotin,而免疫熒光和流式應(yīng)用可根據(jù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的需要,選擇不同熒光素標(biāo)記的二抗,如FITC、Cy3、PE等。



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